Вместе со зданиями музея родились концепция и понятие "этнокосмология" – созданная литовским народом модель Космического мира, система коммуникации с ним и уважение к нему. Постановлением президиума Академии наук от 15 марта 1990 года был основан Этнокосмологический музей.